| 書誌種別 |
図書 |
| タイトル |
システム生物学入門 |
| サブタイトル |
生物回路の設計原理 |
| タイトルヨミ |
システム セイブツガク ニュウモン |
| サブタイトルヨミ |
セイブツ カイロ ノ セッケイ ゲンリ |
| 人名 |
Uri Alon／著
倉田 博之／訳
宮野 悟／訳
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| 人名ヨミ |
Uri Alon クラタ ヒロユキ ミヤノ サトル |
| 出版者・発行者 |
共立出版
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| 出版者・発行者等ヨミ |
キョウリツ シュッパン |
| 出版地・発行地 |
東京 |
| 出版・発行年月 |
2008.10 |
| ページ数または枚数・巻数 |
10,291p |
| 大きさ |
26cm |
| 価格 |
￥５２００ |
| ISBN |
978-4-320-05673-2 |
| ISBN |
4-320-05673-2 |
| 注記 |
原タイトル:An introduction to systems biology |
| 注記 |
文献:章末,p263〜286 |
| 分類記号 |
463.7
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| 件名 |
形態形成
／
生物数学
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| 内容紹介 |
生物学のパラダイム変換を推し進めていけば、生物の中にも基本的原理や法則があることを想定できる。生物システムの設計原理のいくつかにスポットを当て、生物ネットワークを理解できるような数学的枠組みを示す。 |
| 言語区分 |
jpn |
| タイトルコード |
1009811125131 |
| 目次 |
第1章 序 |
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参考文献 |
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第2章 転写ネットワーク:基本概念 |
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2.1 はじめに／2.2 細胞の内外環境の認知問題／2.3 転写ネットワークを構成している要素／2.4 単純な遺伝子制御のダイナミクスと応答時間／参考文献／演習問題 |
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第3章 自己制御:ネットワークモチーフ |
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3.1 はじめに／3.2 パターン,ランダムネットワーク,ネットワークモチーフ／3.3 自己制御:ネットワークモチーフ／3.4 負の自己制御による遺伝子回路の応答時間の加速／3.5 負の自己制御による産生揺らぎに対するロバストネスの促進／3.6 まとめ／参考文献／演習問題 |
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第4章 フィードフォワードループネットワークモチーフ |
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4.1 はじめに／4.2 ランダムネットワークにおける部分グラフの出現回数／4.3 フィードフォワードループはネットワークモチーフ／4.4 フィードフォワードループ遺伝子回路の構造／4.5 AND論理下でのタイプ1コヒーレントFFLの動的挙動／4.6 タイプ1コヒーレントFFLはオン・オフ感知性の遅延要素／4.7 タイプ1インコヒーレントFFL／4.8 なぜある種のFFLはまれにしか現れないのか／4.9 FFLの収束進化／4.10 まとめ／参考文献／演習問題 |
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第5章 転写ネットワークの時間プログラムと全体構造 |
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5.1 はじめに／5.2 単入力モジュール(SIM)ネットワークモチーフ／5.3 SIMは時間発現プログラムを作り出す／5.4 ネットワークモチーフの形状的一般化／5.5 マルチ出力FFLによるFIFO時間順序の生成／5.6 シグナルの統合化と組合せ制御:バイファンと密重複レギュロン／5.7 センサー型転写ネットワークのネットワークモチーフと大域的構造／参考文献／演習問題 |
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第6章 発生,シグナル伝達,神経ネットワークのネットワークモチーフ |
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6.1 はじめに／6.2 発生転写ネットワークのネットワークモチーフ／6.3 シグナル伝達ネットワークのネットワークモチーフ／6.4 多層パーセプトロンを使った情報処理／6.5 合成ネットワークモチーフ:負のフィードバックと振動モチーフ／6.6 線虫の神経ネットワークにおけるネットワークモチーフ／6.7 まとめ／参考文献／演習問題 |
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第7章 タンパク質回路のロバストネス:綱菌の走化性の例 |
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7.1 ロバストネスの原理／7.2 細菌の走化性,細菌の思考方法／7.3 大腸菌の走化性タンパク質回路／7.4 正確な適応を説明する2つのモデル:ロバストとファイチューン／7.5 細菌走化性の個性とロバストネス／参考文献／演習問題 |
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第8章 発生のロバストなパターニング |
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8.1 はじめに／8.2 モルフォゲン指数分布はロバストではない／8.3 自己強化モルフォゲン分解によるロバストネスの増大／8.4 ロバストなパターニングのために分解フィードバックを用いるネットワークモチーフ／8.5 ロバストネス原理を用いてショウジョウバエのパターニングのメカニズムを解明する／参考文献／演習問題 |
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第9章 動力学的校正 |
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9.1 はじめに／9.2 遺伝暗号の動力学的校正は分子認識の誤り率を低下させる／9.3 免疫系は自己と非自己を識別する／9.4 動力学的校正は細胞内の多様な認識プロセスで行われる／参考文献／演習問題 |
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第10章 最適遺伝子回路設計 |
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10.1 はじめに／10.2 一定条件下のタンパク質の最適発現レベル／10.3 制御することしないこと:可変的環境の最適制御／10.4 フィードフォワードループネットワークモチーフの環境選択／10.5 まとめ／参考文献／演習問題 |
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第11章 遺伝子制御の需要法則 |
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11.1 はじめに／11.2 Savageauの需要法則／11.3 最小エラー負荷に基づく遺伝子制御の法則／11.4 最適制御に対する選択圧／11.5 マルチレギュレーターシステムに対する需要法則／11.6 まとめ／参考文献／演習問題 |
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第12章 エピローグ:生物学の単純性 |
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付録1 遺伝子の入力関数:ミカエリス-メンテン式とヒル式 |
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A1.1 リプレッサーとプロモーターの結合／A1.2 インデューサーとリプレッサータンパク質の結合:ミカエリス-メンテン式／A1.3 インデューサー結合とヒル方程式の協同作用／A1.4 Monod,Changeux,Wymannのモデル／A1.5 リプレッサーが制御する遺伝子の入力関数／A1.6 アクチベーターとDNA部位の結合／A1.7 ミカエリス-メンテン酵素反応式／参考文献／演習問題 |
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付録2 多次元入力関数 |
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アクチベーターとリプレッサーを統合する入力関数／演習問題 |
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付録3 転写ネットワークのグラフ性質 |
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A3.1 転写ネットワークは疎である／A3.2 転写ネットワークは裾の長い出力次数列とコンパクトな入力次数列をもつ／A3.3 転写ネットワークのクラスタリング係数／A3.4 ネットワークモジュールの定量的尺度 |
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付録4 遺伝子発現の細胞間変動 |
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参考文献 |
