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資料の状態
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| No. |
資料番号 |
資料種別 |
請求記号 |
配架場所 |
状態 |
貸出
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| 1 |
0016912354 | 図書一般 | 467.3/ﾏﾂ25/ | 2F自然 | 貸出中 |
× |
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書誌情報サマリ
| タイトル |
トランスクリプトーム解析
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| 人名 |
松本 拡高／著
|
| 人名ヨミ |
マツモト ヒロタカ |
| 出版者・発行者 |
コロナ社
|
| 出版年月 |
2025.4 |
書誌詳細
この資料の書誌詳細情報です。
| 書誌種別 |
図書 |
| タイトル |
トランスクリプトーム解析 |
| シリーズ名 |
バイオインフォマティクスシリーズ |
| シリーズ番号 |
6 |
| タイトルヨミ |
トランスクリプトーム カイセキ |
| シリーズ名ヨミ |
バイオインフォマティクス シリーズ |
| シリーズ番号ヨミ |
6 |
| 人名 |
松本 拡高／著
浜田 道昭／監修
|
| 人名ヨミ |
マツモト ヒロタカ ハマダ ミチアキ |
| 出版者・発行者 |
コロナ社
|
| 出版者・発行者等ヨミ |
コロナシャ |
| 出版地・発行地 |
東京 |
| 出版・発行年月 |
2025.4 |
| ページ数または枚数・巻数 |
10,216p |
| 大きさ |
21cm |
| 価格 |
￥３６００ |
| ISBN |
978-4-339-02736-5 |
| ISBN |
4-339-02736-5 |
| 注記 |
文献:p201〜213 |
| 分類記号 |
467.3
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| 件名 |
バイオインフォマティクス
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| 内容紹介 |
トランスクリプトーム解析の原理を体系的にまとめ、基盤となる基礎的なアルゴリズムや理論を、本質を押さえながら簡略化して解説。また、確率モデルの式変形などを、途中経過も含め丁寧に説明する。 |
| 著者紹介 |
東京大学大学院新領域創成科学研究科博士課程修了(メディカル情報生命専攻)、博士(科学)。長崎大学准教授。 |
| 言語区分 |
JPN |
| タイトルコード |
1009812838306 |
| 目次 |
1.分子生物学とトランスクリプトーム解析の基礎 |
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1.1 ゲノムとは／1.2 DNAシークエンサー／1.3 RNA・タンパク質・遺伝子とは／1.4 トランスクリプトームとは／1.5 ゲノムアノテーション／1.6 RNAシークエンシング／1.7 本章のまとめ |
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2.トランスクリプトームアセンブリ |
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2.1 配列アセンブリ／2.2 de novoトランスクリプトームアセンブリ／2.3 リファレンスベースドアセンブリ／2.4 コンティグの機能アノテーション／2.5 本章のまとめ |
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3.リードマッピング |
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3.1 力まかせな文字列探索／3.2 高速なリードマッピング／3.3 スプリットリードのマッピング／3.4 本章のまとめ |
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4.発現量の定量 |
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4.1 アライメントベースな発現量定量化／4.2 アライメントフリーな発現量定量化／4.3 5'端・3'端RNA‐seqにおける発現量定量／4.4 本章のまとめ |
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5.発現変動解析 |
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5.1 アノテーションに基づく発現変動解析／5.2 スプライシング変動解析／5.3 ポリアデニル化サイト変動解析／5.4 新規転写単位・構造の検出／5.5 バイアスの補正／5.6 本章のまとめ |
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6.高次解析 |
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6.1 「生物学的特徴」を表す遺伝子セット／6.2 エンリッチメント解析／6.3 レギュロン解析／6.4 本章のまとめ |
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7.次元圧縮 |
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7.1 層別化医療と次元圧縮・クラスタリング／7.2 主成分分析／7.3 ラプラシアン行列に基づく次元圧縮／7.4 SNE,symmetric SNE,t‐SNE／7.5 ポアンカレ埋め込み／7.6 遺伝子選択／7.7 本章のまとめ |
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8.クラスタリング |
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8.1 k‐means法／8.2 グラフカットとスペクトラルクラスタリング／8.3 DBSCAN／8.4 Louvain法／8.5 本章のまとめ |
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9.1細胞RNA‐seq解析 |
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9.1 なぜ1細胞か／9.2 細胞種の同定／9.3 擬時間解析／9.4 RNA velocity／9.5 細胞間相互作用の推定／9.6 1細胞RNA‐seqにおける発現変動解析／9.7 本章のまとめ |
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10.発展的な計測技術 |
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10.1 超多検体RNA‐seq／10.2 1細胞RNA‐seqからマルチモーダル計測へ／10.3 ゲノム編集を利用した技術／10.4 空間トランスクリプトーム／10.5 ダイレクトRNAシークエンシング／10.6 本章のまとめ |
目次
内容細目
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