書誌種別 |
図書 |
タイトル |
バイオインフォマティクス |
タイトルヨミ |
バイオインフォマティクス |
人名 |
A.ポランスキ/著
M.キンメル/著
後藤 修/訳
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人名ヨミ |
A ポランスキ M キンメル ゴトウ オサム |
人名ヨミ |
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出版者・発行者 |
シュプリンガー・ジャパン
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出版者・発行者等ヨミ |
シュプリンガー ジャパン |
出版地・発行地 |
東京 |
出版・発行年月 |
2010.10 |
ページ数または枚数・巻数 |
16,383p |
大きさ |
24cm |
価格 |
¥6500 |
ISBN |
978-4-431-10094-2 |
ISBN |
4-431-10094-2 |
注記 |
原タイトル:Bioinformatics |
注記 |
文献:p361〜378 |
分類記号 |
467.3
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件名 |
バイオインフォマティクス
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内容紹介 |
これからバイオインフォマティクスの研究に携わる人のために、数学・情報学の基礎のほか、ゲノム配列決定とアノテーション、タンパク質・RNAの高次構造予測、集団遺伝学と分子進化といった主要な応用分野を解説する。 |
言語区分 |
jpn |
タイトルコード |
1009811348542 |
目次 |
第1章 はじめに |
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1.1 バイオインフォマティクスの起源/1.2 バイオインフォマティクスと他の研究分野/1.3 さらなる開発:線形情報から多次元構造組織へ/1.4 数理的および計算的手法/1.5 応用 |
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第Ⅰ部 数理的および計算的手法 |
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第2章 確率と統計 |
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2.1 確率計算の規則/2.2 確率変数/2.3 離散分布と連続分布の例/2.4 最尤推定/2.5 パラメータを推定する他の方法:比較研究/2.6 期待値最大化法/2.7 統計的検定/2.8 マルコフ連鎖/2.9 マルコフ連鎖モンテカルロ(MCMC)法/2.10 隠れマルコフモデル/2.11 演習問題 |
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第3章 コンピュータ科学のアルゴリズム |
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3.1 アルゴリズム/3.2 ソートとクイックソート/3.3 文字列検索,高速検索/3.4 文字列のための索引構造,検索トライ,接尾辞木/3.5 バローズ-ホイーラー変換/3.6 ハッシング/3.7 演習問題 |
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第4章 パターン解析 |
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4.1 特徴抽出/4.2 分類/4.3 クラスタリング/4.4 次元削減,主成分分析/4.5 パラメトリック変換/4.6 演習問題 |
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第5章 最適化 |
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5.1 静的最適化/5.2 動的計画法/5.3 組合せ最適化/5.4 演習問題 |
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第Ⅱ部 応用 |
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第6章 配列アラインメント |
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6.1 可能なアラインメントの数/6.2 ドットマトリックス/6.3 一致と不一致へのスコアリング/6.4 スコア関数の開発/6.5 動的計画法を用いた配列アラインメント/6.6 データベースに対する配列アラインメント/6.7 多重配列アラインメント法/6.8 演習問題 |
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第7章 分子系統学 |
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7.1 系統樹:用語と方法/7.2 系統樹作成方法の概要/7.3 距離法に基づいた系統樹/7.4 最尤推定(フェルゼンシュタイン)系統樹/7.5 最大節約系統樹/7.6 系統樹モデルに関する様々な話題/7.7 合祖理論/7.8 演習問題 |
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第8章 ゲノミクス |
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8.1 DNA分子と分子生物学のセントラルドグマ/8.2 ゲノム構造/8.3 ゲノム配列の決定/8.4 ゲノムアセンブリのアルゴリズム/8.5 ゲノムのカバーの統計学/8.6 ゲノムアノテーション/8.7 演習問題 |
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第9章 プロテオミクス |
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9.1 タンパク質構造/9.2 アミノ酸配列とタンパク質構造の実験的決定/9.3 分子構造モデリングのコンピュータ科学的手法/9.4 コンピュータによるタンパク質の構造と機能予測/9.5 演習問題 |
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第10章 RNA |
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10.1 RNAワールド仮説/10.2 RNAの機能/10.3 逆転写によるRNA鎖配列決定/10.4 ノーザンプロット/10.5 RNAの一次構造/10.6 RNAの二次構造/10.7 RNAの三次構造/10.8 RNA二次構造のコンピュータによる予測/10.9 配列比較解析によるRNA構造予測/10.10 演習問題 |
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第11章 DNAマイクロアレイ |
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11.1 DNAマイクロアレイの設計/11.2 結合過程の速度論/11.3 データの前処理と規格化/11.4 遺伝子発現プロファイルの統計/11.5 クラス予測とクラス発見/11.6 次元の削減/11.7 クラス発見/11.8 クラス予測,特異的発現を示す遺伝子/11.9 多重検定と偽発見率(FDR)解析/11.10 Gene Ontologyデータベース/11.11 演習問題 |
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第12章 生物情報データベースとインターネット資源 |
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12.1 ゲノムデータベース/12.2 タンパク質データベース/12.3 RNAデータベース/12.4 遺伝子発現データベース/12.5 オントロジー・データベース/12.6 遺伝子・タンパク質のパスウェイ・データベース/12.7 プログラムとサービス/12.8 医学データベース |